Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DCAF6Q58WW2 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms