Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC18A3Q16572 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms