Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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PTPN13Q12923 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PTPN13Q12923 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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