Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CEP89-207ENST00000591863 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MIS12-202ENST00000573759 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PHLPP2-204ENST00000567016 4812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC25A5-AS1-203ENST00000446986 1874 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 LILRB1-208ENST00000427581 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CD300CQ08708 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms