Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
REG3AQ06141 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms