Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL133353.1-201ENST00000452391 303 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL136418.1-201ENST00000551799 975 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LHX9-202ENST00000367388 758 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC016394.1-201ENST00000608444 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC006449.2-201ENST00000618407 486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms