Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms