Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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CBX1P83916 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CBX1P83916 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX1P83916 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CBX1P83916 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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CBX1P83916 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CBX1P83916 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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