Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COG7P83436 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COG7P83436 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COG7P83436 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms