Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LAMA4-201ENST00000230538 6547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 FAM95B1-201ENST00000455995 4236 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HERVK_113P61574 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms