Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCCD1P59942 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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