Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BRPF1P55201 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms