Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMTNP53814 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms