Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AP003072.3-201ENST00000623456 594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 INSL6-201ENST00000381641 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSEN1P49768 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms