Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SPINK2-201ENST00000248701 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC008894.2-202ENST00000599676 1027 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VEGFBP49765 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms