Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TM4SF4P48230 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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