Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GGCXP38435 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GGCXP38435 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms