Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms