Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM21P19474 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms