Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCP1P17987 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCP1P17987 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms