Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HOXB9P17482 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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