Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RALAP11233 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RALAP11233 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RALAP11233 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RALAP11233 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RALAP11233 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RALAP11233 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RALAP11233 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms