Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
F13BP05160 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
F13BP05160 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
F13BP05160 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms