Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CREB3O43889 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CREB3O43889 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms