Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SMIM1B2RUZ4 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms