Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms