Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CTNNBIP1Q9NSA3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms