Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRTQ9BXP5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRTQ9BXP5 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms