Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SGCZQ96LD1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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