Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C18orf8Q96DM3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms