Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP13Q92995 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP13Q92995 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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