Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ARRDC4Q8NCT1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms