Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC50Q8IVM0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms