Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DCAF6Q58WW2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms