Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
HERC3Q15034 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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