Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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