Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HSPB3Q12988 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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