Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PSME1Q06323 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms