Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 OR8J3-201ENST00000301529 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RN7SKP79-201ENST00000363373 336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL008626.1-201ENST00000412357 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL354714.2-201ENST00000425270 1097 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNB1Q02641 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms