Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
SPTBN1Q01082 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms