Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MDM2Q00987 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MDM2Q00987 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms