Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CLTCQ00610 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms