Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP46P62068 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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USP46P62068 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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USP46P62068 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
USP46P62068 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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USP46P62068 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
USP46P62068 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP46P62068 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP46P62068 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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USP46P62068 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
USP46P62068 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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