Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCA4P51532 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA4P51532 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms