Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FDFT1P37268 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.7 ms