Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
VPREB1P12018 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms