Protein–RNA interactions for Protein: P09497

CLTB, Clathrin light chain B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTBP09497 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLTBP09497 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLTBP09497 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms