Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NPIPB9F8W1W9 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms