Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-1B6SEH8 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms