Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CTSFQ9UBX1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTSFQ9UBX1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTSFQ9UBX1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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